Член на Изследователския борд на Американския биографичен институт. Член на Научния съвет на Македонския научен институт (1998-2002). Председател на Националния специализиран експертен съвет за опазване на недвижимите паметници на културата към министъра на културата на България (от 2010 г.).

Наричат Николай Овчаров българския Индиана Джоунс, защото зад всеки камък търси човешка съдба. На него принадлежат едни от най-големите археологически открития у нас. Венец на дейността му е разкриването на скалния град Перперикон и светилището на Орфей край с. Татул в Източните Родопи. Провел е експедиции в Русия, Гърция, Турция, Грузия, Сърбия и Черна Гора, Република Македония. Изследванията му са издадени на английски, немски, френски, италиански, руски, гръцки, сръбски и румънски език.